はじめに
近藤 格
国立がん研究センター研究所希少がん研究分野
本特集の目的は，わが国における臨床プロテオミクスの現状を俯瞰し，本研究分野の可能性と限界を医学研究に携わる方々に理解していただくことである．そのために，疾患研究の専門家のみならず，機器分析，タンパク質生化学，細胞生物学などさまざまな立場から臨床プロテオミクスに携わる研究者にご執筆をお願いした．
“臨床プロテオミクス”とは，臨床に役立つ成果を最終的にめざして行うプロテオミクスだと考えている．臨床検体を用いて行うプロテオミクスが，すなわち臨床プロテオミクスというわけではない．研究のゴールをどこに設定しているか，が本質である．したがって，臨床検体を用いていなくても長期的なゴールを臨床応用にみすえているプロテオミクスも広義には臨床プロテオミクスに含めることができると考えている．
臨床プロテオミクスは今世紀に入り大きく発展した．プロテオームを解明することで疾患の本態が解明され，臨床に役立つ成果が得られるであろうという期待を背景としてプロテオーム研究に膨大な研究費が投下され，技術開発が劇的に進んだ．創薬標的探索，バイオマーカー開発といった，疾患研究のキーワードを目にしないプロテオミクスの学会はなかったといっても過言ではないであろう．たくさんの臨床検体を対象に，できるだけたくさんのタンパク質を定量的に網羅的に再現性よく測定する，という難題に挑むために開発された技術は枚挙にいとまがない．“臨床”という言葉が冠されなければ，プロテオミクスのいまはなかったのではないであろうか．
一方，臨床に役立つ成果が期待されつつ発展してきた臨床プロテオミクスは，その成果が問われる厳しい時期にきている．たとえば，プロテオミクスの技術を用いたバイオマーカー開発は盛んに行われ数多くの論文が出たが，FDAで承認されたものはわずか1件しかない．同様に，プロテオミクスから候補として同定された創薬シーズは実にたくさんあるが，実際に臨床試験に至ったものは数えるほどしかない．したがって，いままでと同じような視点で臨床プロテオミクスを継続することに将来性があるのかどうか，真摯に考えないといけないであろう．
わが国で行われる臨床プロテオミクスが，臨床に役立つ成果を得るという最終ゴールへの過程においてどのあたりに位置するのかを，本特集を読むことでイメージしていただければ幸いである．
