はじめに
岡田随象
東京大学大学院医学系研究科，理化学研究所生命医科学研究センター
ヒトの歴史は感染症との戦いと共生の歴史でもあった．現生人類が有する多彩な表現型の成り立ちには，人類の進化の過程における感染症との関わりが背後に存在している．特に，免疫関連疾患の発症機序におけるウイルス感染症の役割は，基礎・臨床免疫学の長年の謎として，多くの研究者を惹きつけてきた．しかし，膨大な種類のウイルスの感染状況を集団レベルで定量化することは技術的に困難であり，“どのウイルス感染が，どの免疫疾患の発症を，どのように引き起こすのか”という根本的な問いは未解明のままであった．エプスタイン・バール（EB）ウイルスなど現生人類の大半が既感染となるヒトヘルペスウイルスでは，加齢に伴う潜伏感染からの再活性化が知られている．再活性化を惹起する因子や，再活性化がもたらしていると想定される高齢者特異的な疾患発症メカニズムの全体像は依然として不明である．
昨今のゲノム・オミクス解析技術の発展により，ヒト集団における多彩なウイルスの感染状態の網羅的定量化が可能になった．末梢血液や組織由来のDNAを対象に全ゲノムシークエンス（whole genome sequencing：WGS）を実施すると，ウイルス由来のシークエンスリード情報が微量に含まれている．これらの“見過ごされていた”リード情報に着目した遺伝統計解析により，数十万人規模にのぼるバイオバンク由来のWGSを用いた網羅的なウイルス感染スクリーニングが可能となった．従来の血液中に含まれるウイルス抗原特異的抗体のスクリーニングを凌駕するスループット性を有するだけでなく，加齢に伴うウイルス感染の再活性化過程とその個人差の可視化を可能とした．ネオセルフやメチル化など，ウイルス感染が生体内で引き起こす生命現象と，免疫関連疾患発症機序における役割も，明らかとなりつつある．
昨今のワクチン開発技術の革新は，従来は困難であったウイルスも新たなワクチン開発の標的としつつある．感染成立予防だけでなく，潜伏感染後の再活性化をワクチン接種で抑制する新規治療戦略も見出され，これは従来の個別化発症予測や個別化発症医療の概念から，個別化発症抑制へのパラダイムシフトを期待させる．
本特集は，ヒトヘルペスウイルスを中心に，ヒト疾患に関わる重要なウイルスに対して，最先端の専門的知見を紹介することを目的として構成した．御寄稿頂いた先生方にこの場を借りて厚く御礼申し上げるとともに，読者の皆さまの研究の一助となれば幸いである．
岡田随象
東京大学大学院医学系研究科，理化学研究所生命医科学研究センター
ヒトの歴史は感染症との戦いと共生の歴史でもあった．現生人類が有する多彩な表現型の成り立ちには，人類の進化の過程における感染症との関わりが背後に存在している．特に，免疫関連疾患の発症機序におけるウイルス感染症の役割は，基礎・臨床免疫学の長年の謎として，多くの研究者を惹きつけてきた．しかし，膨大な種類のウイルスの感染状況を集団レベルで定量化することは技術的に困難であり，“どのウイルス感染が，どの免疫疾患の発症を，どのように引き起こすのか”という根本的な問いは未解明のままであった．エプスタイン・バール（EB）ウイルスなど現生人類の大半が既感染となるヒトヘルペスウイルスでは，加齢に伴う潜伏感染からの再活性化が知られている．再活性化を惹起する因子や，再活性化がもたらしていると想定される高齢者特異的な疾患発症メカニズムの全体像は依然として不明である．
昨今のゲノム・オミクス解析技術の発展により，ヒト集団における多彩なウイルスの感染状態の網羅的定量化が可能になった．末梢血液や組織由来のDNAを対象に全ゲノムシークエンス（whole genome sequencing：WGS）を実施すると，ウイルス由来のシークエンスリード情報が微量に含まれている．これらの“見過ごされていた”リード情報に着目した遺伝統計解析により，数十万人規模にのぼるバイオバンク由来のWGSを用いた網羅的なウイルス感染スクリーニングが可能となった．従来の血液中に含まれるウイルス抗原特異的抗体のスクリーニングを凌駕するスループット性を有するだけでなく，加齢に伴うウイルス感染の再活性化過程とその個人差の可視化を可能とした．ネオセルフやメチル化など，ウイルス感染が生体内で引き起こす生命現象と，免疫関連疾患発症機序における役割も，明らかとなりつつある．
昨今のワクチン開発技術の革新は，従来は困難であったウイルスも新たなワクチン開発の標的としつつある．感染成立予防だけでなく，潜伏感染後の再活性化をワクチン接種で抑制する新規治療戦略も見出され，これは従来の個別化発症予測や個別化発症医療の概念から，個別化発症抑制へのパラダイムシフトを期待させる．
本特集は，ヒトヘルペスウイルスを中心に，ヒト疾患に関わる重要なウイルスに対して，最先端の専門的知見を紹介することを目的として構成した．御寄稿頂いた先生方にこの場を借りて厚く御礼申し上げるとともに，読者の皆さまの研究の一助となれば幸いである．
特集 免疫疾患とウイルス感染 virome時代の再評価
はじめに（岡田随象）
内在性ヒトヘルペスウイルスと疾患（小嶋将平）
EBウイルス潜伏感染・再活性化と自己免疫疾患（小川陽介・岡田随象）
慢性活動性EBウイルス病の病態とその最新知見（上村 悠・新井文子）
EBウイルス感染と悪性腫瘍（金田篤志）
サイトメガロウイルス感染と自己免疫疾患（飯高早紀子・荒瀬 尚）
亜集団解析が拓くHSV-1増殖機構─ADとの関連を背景に（丸鶴雄平・川口 寧）
水痘帯状疱疹ウイルス感染とリウマチ性疾患（中山田真吾）
HTLV-1感染と神経免疫疾患（山岸 誠）
TOPICS
免疫学 免疫チェックポイント阻害薬の効果を高める腸内細菌株（桃井悠作・西川博嘉）
腎臓内科学 ポドサイトの嫌気性解糖異常から読み解く新たな病態（椙村真裕・前田佳哉輔）
連載
医療にいかす行動経済学(26)
現代哲学・倫理学における合理性と非合理性（河野哲也）
知っておくと役に立つ！臨床医のための臨床検査医学講座(14)
知って得する脂質代謝関連検査（蔵野 信）
ネオ免疫学 生命進化に学ぶ免疫学のパラダイムシフト(3)
適応免疫はどのように生まれたのか─ヤツメウナギに見る抗原受容体のもうひとつの設計（森本 亮）
FORUM
分子生物学の臨床応用 “分子“から“疾患・患者”へ(13) 機能的オルガノイドを活用したがん発生機構の解明と治療開発（加藤智尋・他）
次号の特集予告
はじめに（岡田随象）
内在性ヒトヘルペスウイルスと疾患（小嶋将平）
EBウイルス潜伏感染・再活性化と自己免疫疾患（小川陽介・岡田随象）
慢性活動性EBウイルス病の病態とその最新知見（上村 悠・新井文子）
EBウイルス感染と悪性腫瘍（金田篤志）
サイトメガロウイルス感染と自己免疫疾患（飯高早紀子・荒瀬 尚）
亜集団解析が拓くHSV-1増殖機構─ADとの関連を背景に（丸鶴雄平・川口 寧）
水痘帯状疱疹ウイルス感染とリウマチ性疾患（中山田真吾）
HTLV-1感染と神経免疫疾患（山岸 誠）
TOPICS
免疫学 免疫チェックポイント阻害薬の効果を高める腸内細菌株（桃井悠作・西川博嘉）
腎臓内科学 ポドサイトの嫌気性解糖異常から読み解く新たな病態（椙村真裕・前田佳哉輔）
連載
医療にいかす行動経済学(26)
現代哲学・倫理学における合理性と非合理性（河野哲也）
知っておくと役に立つ！臨床医のための臨床検査医学講座(14)
知って得する脂質代謝関連検査（蔵野 信）
ネオ免疫学 生命進化に学ぶ免疫学のパラダイムシフト(3)
適応免疫はどのように生まれたのか─ヤツメウナギに見る抗原受容体のもうひとつの設計（森本 亮）
FORUM
分子生物学の臨床応用 “分子“から“疾患・患者”へ(13) 機能的オルガノイドを活用したがん発生機構の解明と治療開発（加藤智尋・他）
次号の特集予告
